Variances of Parental Genome Contribution

According to Frisch and Melchinger (2007 & 2010) approach, the variances of parental genome contribution of k^{th} chromosome with length l_k in different mating systems can be written as follow:

  • F1-DH
  • \frac{1}{l_k^2}\cdot \frac{1}{4}\left[l_k-\frac{1}{2}\left(1-e^{-2l_k}\right)\right]

  • F2
  • \frac{1}{l_k^2}\cdot \frac{1}{8}\left[l_k-\frac{1}{2}\left(1-e^{-2l_k}\right)\right]

  • F3
  • \frac{1}{l_k^2}\cdot \frac{1}{128}\left[20l_k+8e^{-2l_k}+e^{-4l_k}-9\right]

  • Ft+1
  • \frac{1}{l_k^2}\cdot \sum _{n=1}^t \left(\frac{1}{2}\right)^{n+3}\frac{1}{n^2}\left[2nl_k-1+e^{-2nl_k}\right]

  • BCt
  • \frac{1}{l_k^2}\cdot \frac{1}{4^{t+1}}\sum _{n=1}^t \left(\begin{array}{c}t\\n\end{array}\right)\frac{1}{2n^2}\left[2nl_k-1+e^{-2nl_k}\right]

  • F2-Synt
  • \frac{1}{l_k^2}\cdot \frac{1}{8(t+1)}\left[l_k\left(2-\frac{1}{2^t}\right)-\frac{1}{2^{t+1}}\sum_{n=1}^{t+1} \left(\begin{array}{c}t+1\\n\end{array}\right)\frac{1}{n}\left(1-e^{-2nl_k}\right)\right]

  • (F1)t -DH
  • \frac{1}{l_k^2}\cdot \frac{1}{4(t+1)}\left[l_k\left(2-\frac{1}{2^t}\right)-\frac{1}{2^{t+1}}\sum_{n=1}^{t+1} \left(\begin{array}{c}t+1\\n\end{array}\right)\frac{1}{n}\left(1-e^{-2nl_k}\right)\right]

  • (F2)t -SSD
  • \frac{1}{l_k^2}\cdot \frac{1}{2^{t+2}}\sum _{n=1}^{t+1} \left(\begin{array}{c}t\\n-1\end{array}\right)\left[2^{n-1}\varepsilon _6+2\sum _{m=1}^{n-1} \varepsilon _3\left(\varepsilon _7-l_k\right)\right]\begin{array}{c}*\\\ \end{array}

  • BCt -DH
  • \frac{1}{l_k^2}\cdot \frac{1}{4^{t+1}}\sum _{n=1}^{t+1} \left(\begin{array}{c}t+1\\n\end{array}\right)\frac{1}{2n^2}\left[2nl_k-1+e^{-2nl_k}\right]

  • BCt -SSD
  • \frac{1}{l_k^2}\cdot \frac{1}{4^{t+1}}\left\{\varepsilon _6+\sum _{n=1}^t \left(\begin{array}{c}t\\n\end{array}\right)\left[2^n\varepsilon _6+4\sum _{m=1}^{n-1} \varepsilon _3\left(\varepsilon _7-l_k\right)\right]\right\}\begin{array}{c}*\\\ \end{array}

    *
    \varepsilon _3=\frac{2^{m-2}}{n-m}
    \varepsilon _6=l_k\ln 2-\frac{1}{2}\textrm{dilog}\left(\frac{1}{2}\right)+\frac{1}{2}\textrm{dilog}\left(1-\frac{1}{2}e^{-2l_k}\right)
    \varepsilon _7=\frac{1-e^{-2l_k(n-m)}}{2(n-m)}

    References:
    FRISCH, M. AND A. E. MELCHINGER (2007). "Variance of the parental genome contribution to inbred lines derived from biparental crosses." Genetics 176(1): 477-488.
    MELCHINGER, A. E., B. S. DHILLON, ET AL. (2010). "Variation of the parental genome contribution in segregating populations derived from biparental crosses and its relationship with heterosis of their Design III progenies." Theoretical and Applied Genetics 120(2, Sp. Iss. SI): 311-319.

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    僥倖

    暖暖的台北
    那麼教人感動的溫柔
    整個城市
    像一句默契的謊言
    夢般虛幻華麗

    是浪漫的誰?
    在天空裡儲蓄了思念
    思念著甜美的笑容
    和溜掉的眼神

    時間走了
    勇氣還是不敢長大
    也只好
    用眼睛捕捉的零點一秒
    來給漫長的晚上
    僥倖著
    停滯的身影還是足以編織
    夢裡的我和妳的婚禮

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    音樂會

    風選擇了自己樂章
    來到了這些日子的耳邊
    或許
    這些日子已不再擁有甚麼
    還好這輕柔的風吹過
    最後還能留著一些些的記憶
    習慣了所以忘記了?
    亦是疲累了所以放棄了?
    終於承諾也變成了這陣耳邊的風
    快跑的流
    輕易地觸動了這些日子以來的異國
    過了許久
    依然還是一個樣
    聽著風的交響落下了眼淚
    感嘆著那年的我們
    傻傻的浪漫

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    Happy Today

    Some kind of couplin
    that recognize my receptor
    it’s from you
    just can’t help
    and become addicted
    it’s all chemical
    and quantum-decided
    maybe someone write it
    but not me
    mankind’s known has its limit
    that’s why tell no why

    Am I thinking of you?
    everything around me
    gives the impulse
    should it last convergently
    to the time axis
    but it’s forever
    I’m glad to me and mine
    though it’s easy
    to chemically sensitive
    in other words
    another word

    Anyway
    this moment
    I’m yours
    and happy today
    to you

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    貓咪在我的劇本裡頭睡著了

    貓咪
    在我的劇本裡頭睡著了
    剛剛戚依依的男朋友
    給了它半條腸兒
    看它這可愛的樣子
    應該還在回味著呢

    敏輕輕撫摸著它柔柔的毛
    好不讓它醒來
    你看 好心疼它喔
    貓咪睜開惺忪的雙眼看著敏
    迷迷糊糊地
    該選擇夢呢
    還是我的劇本
    還是劇本裡頭的夢

    貓咪
    舔著敏的小手
    喵著它的語言說
    我喜歡妳

    幾點了?
    我夢見我也在的劇本裡頭睡著了
    劇本仍然上演著
    或許
    這個就叫想念~

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    暖化

    全球暖化的我
    穿得少少的
    覺得蠻適應的
    進化 我選擇了進化

    也許過得沒有重點
    但卻也很平靜

    甚麼原因?
    只能說 有一天的偷偷觀察
    就開始幻想了
    我們倆在製做心型的巧克力

    全球暖化 熱熱的
    睏出我的白日夢
    多麼浪漫

    顫音的吉他聲 潺潺流水似的
    甚麼時候韻味變成了琵琶
    靜靜的 就聽到

    進化成被自己感動 你們說的自戀

    燈關上 是浪漫 不是節能減碳
    預告了來著的幸福
    無論如何
    一把吉他 一首想妳的夜

    全球暖化 我回收再利用我的情感
    那奶粉罐突然變成了可愛爵士鼓
    燈依然關著 留下燭光

    我的心已經被暖化
    相信嗎 我真的可以給妳

    這靜靜的 浪漫

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    七彩小羊與大黑狼

    每次上台表演過後
    都會有種不捨得的感覺
    已經很久沒有這種感覺了
    我不把這支舞當作是成績計分
    而把它看成是一個演出 一個合作的成果

    我喜歡舞台
    舞台的我充滿自信
    我敢說這是那些永遠在台下的人沒辦法有的感覺

    我是一隻自閉的靛色小羊
    他們總愛欺負我
    後來 我只好跟大黑狼合作
    他把欺負我的六隻小羊都吃掉了

    我享受同學給我們的掌聲
    也謝謝嘖嘖組的組員
    雖然台下我和你們沒有太多溝通
    但我想說
    能跟你們同組真好
    我喜歡可愛的你們
    我不會忘記這些練習日子來的歡樂

    我好想再有一次舞台
    這次寒假回家我想像以前一樣寫寫歌 彈彈吉他
    廢了好久
    在台灣都在念書
    這裡寒冷的天 讓我覺得好累
    期待

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    有的沒的

    我每天都在念書
    這學期真的很瘋狂地在學習
    我都會很鼓勵我身邊的朋友 多看點書
    然而 我開始要保留這句話了
    不是說念書不好 或者念書會限制你的創造力
    而是今天大部分的人都失去了判斷知識的能力
    這也是因為少念書帶來的效應
    如果說今天這些人要開始補救 多念點書
    已經來不及了
    因為人類的邏輯思考越來越沒落
    說難聽點 很多學術研究者都變笨了
    這些人只會帶給別人更多的疑惑 更多的錯誤

    今天做學術研究的事並沒有那麼單純
    憑良心說 你想考進研究所的目的是甚麼?
    系上有個同學告訴我說
    你知道的東西 只有一半是對的 另一半都是錯的
    可是 這個並不叫人納悶
    讓人納悶的是 你並不知道哪一半是對的 哪一半是錯的

    有人很喜歡向老師發問問題
    比如問粒線體內膜電子傳遞的情形
    他們很想知道 在某個瞬間 某一顆電子傳給誰
    天啊!
    這位仁兄 你可能知道細胞有多大
    但你好像不知道跟細胞比起來 細胞膜有多大
    跟細胞膜比起來 膜蛋白又有多大
    我也不知道 我猜應該是一個歐亞大陸和一棟 101 大樓之間的比例吧

    人很喜歡去探討最大或最小的事物 或者那些很要遠 比如人跟 DNA 的距離那麼遙遠
    然後認為弄懂了這些事 自己就會漸漸掌握根本
    那根本又是甚麼?

    我只想說 對於無法確定的事情
    你可以設計一套 model 去估計它 當然你的數學必須要很好
    但你要知道自己的極限
    就像你可以統計大台北地區屈臣氏一年的營業額是多少
    但如果你不是林昭京
    林昭京又沒有告訴你的話
    你永遠沒辦法知道他在屈臣氏花了多少錢 可能他自己都不知道

    總覺得最近的生活有點冗
    好像很想追求些甚麼 可是又好像不是
    我需要靈感

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    黃昏

    不知從哪時候
    我開始愛上黃昏
    覺得
    黃昏很漂亮 很舒服

    所以我決定
    在我有生之年
    我都可以很暢快地度過每一個黃昏
    靜靜地 跟黃昏在一起

    不管白天的煩惱不快
    還是黑夜的即將來臨
    這段時間一定是要忘卻一切的
    不想思考 不想決定 不想聆聽誰的話 不想說話

    年紀大了
    我越來越貪婪
    我變得想操控一切
    包括最艱難的自己
    我想計算出人一生之中 有多少時間是快樂的 有多少時間是想它快點過去的
    然後把快樂的時間集中放在黃昏的時候
    我總有能力做這樣的安排吧?
    我不要求把不快樂的時間都抹去
    我只要讓快樂的時間有一種確定性
    這樣 我就會有所期待

    期待快樂的這段時間 快不快樂都變得不那麼重要
    你說這會使我錯過很多事情
    人一生中做過最多的事情 不就是錯過嗎?
    笨老天把快樂不快樂的時間灑在不確定的時間軸上
    這會讓我錯過得更多ㄟ

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